Praziquantel, ein teilweise hydriertes Isoquinolin-Pyrazin, ist ein farb- und geruchloses, hygroskopisches, bitter schmeckendes, kristallines Pulver (Thomas 1977a; Roberson 1995a). Der chemische Name lautet 2-(cyclohexylcarbonyl)-1,2,3,6,7,11b-hexahydro-4H-pyrazino[2,1-a]isoquinolin-4-on, (C19H24N2O2). Der Schmelzpunkt liegt bei 136 - 138°C (Andrews 1983a; Windholz 1983a), das Molekulargewicht beträgt 312,42 (Thomas 1977a).
Praziquantel ist nur wenig in Wasser löslich. In 100 ml Wasser lassen sich bei 25°C 0,04 g Praziquantel lösen. Die Löslichkeit in Chloroform und Dimethylsulfoxid ist sehr gut (Thomas 1977a). In 100 ml Ethanol lassen sich 9,7 g Praziquantel lösen (Roberson 1995a).