Velagliflozin hat ein Molekulargeweicht von 395,4 g/mol, seine chemische Bezeichnung bzw. sein IUPAC Name lautet 2-[(4-cyclopropylphenyl)methyl]-4-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]benzonitril und die Summenformel beträgt C₂₃H₂₅NO₅ (NCBI 2011a).

Im Arzneimittel liegt der Wirkstoff als Velagliflozinprolinhydrat vor, dabei bildet Velagliflozin einen Co-Kristall mit L-Prolin ((S)-Pyrrolidin-2-Carbonsäure). Es handelt sich um ein Monohydrat; Velagliflozin, L-Prolin und Wasser liegen im Verhältnis 1:1:1 vor. Die Summenformel von Velagliflozinprolinhydrat lautet C₂₈H₃₆N₂O₈; das Molekulargewicht beträgt 528,6 g/mol. (Boehringer Ingelheim Animal Health 2023a)